La estructura periférica del Cuerpo se encuentra presente a lo largo de los 8.000 kilómetros de las costas nacionales, y está articulada en los siguientes Mandos Periféricos :
- 15 Direcciones Marítimas;
- 54 Capitanías de Puerto;
- 47 Oficinas de Circunscripción Marítima;
- 126 Oficinas Locales Marítimas;
- 38 Delegaciones de Playa;
Además forman parte del Cuerpo :
- la flotilla aeronaval;
- la estación satelitaria COSPAS/ SARSAT de Bari ( en sinergia con la Protección Civil);
- los 3 Núcleos de Operadores Subáqueos (San Benedetto del Tronto, Nápoles y Messina);
- el Departamento Ambiente Marino de las Capitanías de Puerto que se encuentran en el Ministerio del Ambiente y de la Tutela del Territorio;
- el Núcleo en la Dirección General de la Pesca del Ministerio para Políticas Agrícolas y Forestales.
